小肠间质瘤是一个潜在恶性的肿瘤，早期间质瘤的病人可以是良性肿瘤，如果能够早发现、早诊断、早治疗，肿瘤没有扩散和转移，通过根治性的手术切除，一般是可以治愈的。
中晚期的间质瘤的病人会出现扩散和转移，小肠间质瘤晚期的症状主要是腹痛、便秘、恶心、呕吐、大便出血，便血是非常典型的肠道肿瘤的症状，出现这些症状的病人需要尽快的通过肠镜检查发现肿瘤，通过病理诊断确诊癌症。