溃疡性结肠炎的临床表现是反复发作的腹泻、黏液脓血便及腹痛，起病多为亚急性，少数急性起病，病程呈慢性经过，发作与缓解交替，少数症状持续，并逐渐加重。
病情轻重与病变范围、临床分型及病期等有关，腹泻和黏液脓血便见于绝大多数的患者，腹泻主要与炎症导致大肠黏膜，对水、钠吸收障碍，以及结肠运动功能失常有关。黏液脓血便是本病活动期的重要表现，是黏膜炎性渗出、糜烂及溃疡所致。腹痛多位于左下腹或下腹，为轻至中度的腹痛，也可累及全腹，常有里急后重，便后腹痛缓解，其他症状还可以有腹胀、食欲不振、恶心、呕吐等等。