腿莫名其妙的疼原因很多，有以下几点：
一、有可能是肌源性、软组织炎性，因为腿可能过度疲劳，或者着凉、劳累，都可能引起腿的肌筋膜炎，出现软组织损伤而引起疼痛。
二、有可能是神经元性，有些可能是因为腰椎间盘突出、腰椎管狭窄，压迫了支配腿的神经，会导致神经被受压，引起了放射性的腿疼，放电一样的疼。原来可能间盘没有压迫神经这么严重，突然一个原因导致加重了神经的压迫，就会引起腿莫名其妙的出现疼痛。
三、腿疼的原因有可能是关节来源，有些人是因为髋关节病变、髋关节发生了股骨头坏死、髋关节的骨关节炎、髋关节类风湿性关节炎，甚至髋关节的化脓性感染、结核等疾病，都可以引起腿莫名其妙的疼痛。
四、有些可能是因为腿的表面支配皮肤的皮神经损伤，像典型的股外侧皮神经损伤，股外侧皮神经损伤之后，会引起大腿外侧的皮肤莫名其妙就出现疼痛、麻木、针扎样疼等情况。