氯硝西泮的常见副作用包括嗜睡、头昏、共济失调、行为紊乱、异常兴奋、神经过敏、易激惹、肌力减退等。
较少发生的不良反应包括行为障碍、思维不能集中、易暴怒、精神错乱、幻觉、抑郁、皮疹、过敏、咽痛、发热或瘀斑等。
需要注意的是有的人还会出现行走不稳、视力模糊、便秘、腹泻、眩晕、头晕、头痛、气管分泌物过多、恶心、排尿障碍等。一般禁忌应用于妊娠期的妇女以及新生儿，因为氯硝西泮有呼吸抑制的作用。
因此对有严重的阻塞性呼吸疾病或者严重肝肾功能不全的人，要慎重应用或减少剂量。