输卵管堵塞的原因有很多。慢性输卵管炎，像淋病奈瑟菌、结核分枝杆菌、沙眼衣原体等细菌病毒等引起的慢性的炎症，可以引起输卵管伞端的闭锁，或者是能够破坏输卵管黏膜而导致输卵管堵塞。另外，输卵管本身发育不良，有的人长的特别细长，扭曲，输卵管里边的黏膜运动，纤毛运动丧失，管壁的蠕动功能丧失，也会导致输卵管堵塞。一些妇科病，像盆腔炎性疾病的后遗症，也可以引起输卵管堵塞。如果是子宫内膜异位到输卵管上，也可以引起输卵管继发的炎症堵塞。