女性感染念珠菌常常表现为外阴、阴道的炎症，如果是已婚的女性出现了外阴和阴道的念珠菌感染，可以使用碱性液体冲洗阴道，并使用抗霉菌的药物，如达克宁、克霉唑、制霉菌素等。
如果是反复感染，则可以进行分泌物的培养加药物敏感试验，了解敏感的抗生素，使用敏感的药物治疗念珠菌感染。特别是一些顽固的感染，可以加用口服的抗霉菌药物。
如果是未婚女性，口服抗霉菌药物是其良好的治疗方式。如果感染上行，特别是形成盆腔炎，常常需要口服或静脉使用抗霉菌的药物。
另外，治疗念珠菌感染时，还要积极去除感染的病因，特别是滥用抗生素，以及使用一些药物如免疫抑制剂等，都容易导致念珠菌的感染。
糖尿病的病人如果血糖控制不佳，也会出现念珠菌的感染。性伴侣也会造成念珠菌交叉感染，因此，去除病因也非常重要。