甲状腺乳头状滤泡亚型是一种非常好的分化型甲状腺癌，它的恶性程度还是非常低的，是一种惰性的肿瘤，临床上对其讨论比较多。
对于甲状腺乳头状癌滤泡亚型，如果没有出现浸润性的改变，没有出现淋巴结的转移，这种情况下行单纯的腺叶切除即可，无需做预防性的中央区淋巴结清扫。
而对于出现了周围的浸润或者出现了区域的淋巴结转移，还需要根据甲状腺癌根治术的标准来进行手术处理，严重得出现广泛转移时，还应当做改良性的颈部淋巴结清扫。
但是总体来说，甲状腺乳头状癌滤泡亚型是一种非常好的恶性肿瘤，是一种预后可以达到治愈的临床肿瘤。
大部分的患者五年的生存率可以达到90%以上，对于局限性的原位癌或者微小状癌，可以达到长期生存，生存期有可能和正常人是一样的。