甲状腺肿瘤的发生是多因素所导致的结果，最常见的是性病。肿瘤在女性发病率是男性的5-6倍，也就提示性别的因素，可能与甲状腺肿瘤的发病，有着密切的关系，有可能和体内的激素水平，有很大的联系。另外，癌基因也是造成甲状腺肿瘤发生的主要因素之一。目前发现部分的癌基因在甲状腺肿瘤的患者中，出现了过度的表达，另外，还发现TSH-G蛋白腺嘌呤环化酶信号传导通路，所导致的蛋白发生了突变，包括TSH受体跨膜功能区的胞外，以及跨膜段的突变，刺激型GTP结合蛋白的异常的表达，所造成的。另外，部分有家族史的患者，容易造成甲状腺肿瘤的多发，有可能和遗传的因素有一定的关系。部分在幼年，头、颈部以及胸部遭受过X线照射的患儿，也有可能在成年出现甲状腺的肿瘤，尤其是恶性的病变较为多发。