血栓的后果可以分为以下几方面：
第一、动脉血栓的后果，动脉血栓如果发生在肢体会造成肢体缺血、疼痛，严重的可以造成肢体的溃疡和坏死，导致截肢的风险。如果动脉血栓发生在颅内和颈动脉，可发生脑梗塞的症状，轻者可以偏瘫、失语，重者累及生命。动脉血栓发生在脏器，会造成相应脏器的缺血、坏死以及功能改变。如发生在肠系膜动脉可以造成肠管的坏死，甚至造成腹膜炎。如果发生在肾动脉，轻者造成肾脏的疼痛，重者造成肾功能衰竭。
第二、血栓发生在静脉，特别是深静脉，如发生在下肢可以造成肢体的肿胀，如果血栓脱落还可以发生肺栓塞，轻者造成呼吸困难，重者造成晕厥甚至危及生命。如果血栓发生在静脉，如发生在肠系膜静脉或者门静脉也可以造成腹痛、腹胀，同时当病情进一步进展时也可以造成肠管坏死，甚至会造成腹水，以及胃底静脉曲张等严重的并发症。