侵袭性大肠性埃希氏菌肠炎症状明显的患者应当给予卧床休息。按照肠道传染病的原则进行消毒隔离，饮食应当以流质饮食为主，如小米汤、大米汤等，病情发展后可以改用稀饭、面条等，不要进食生冷、油腻以及辛辣等刺激性食物。出现脱水的患者还应当酌情补液。脱水较轻的患者，可以采用世界卫生组织推荐的口服补液盐，效果较好，也比较方便。对于反复呕吐或者严重脱水的患者，还应当考虑给予静脉补液。静脉补液恢复后，应当尽快地改回口服补液盐。另外，对于侵袭性大肠埃希氏菌性肠炎，应当选用敏感的抗菌药物进行治疗，常用的有喹诺酮类药物以及头孢菌素类药物。由于细菌容易出现耐药性，还需要根据当地流行的菌株进行药敏实验，或者经过患者的大便标本进行培养，选择敏感的抗菌药物进行治疗。一般尝试选用静脉滴注配合口服治疗效果也可能更好。此外，中药也有一定的效果。