乙状结肠炎的患者，首先应当注意休息，避免劳累。日常生活中应当避免进食生冷、油腻、辛辣等刺激性食物，避免饮酒，多进食高蛋白、高维生素、易消化低渣饮食。重症的患者还应当给予全肠外营养。
常用的药物主要是氨基水杨酸类，代表性的药物有柳氮磺吡啶，适用于轻中度的结肠炎患者，间歇期可以预防复发，但使用时应当定期复查肝肾功能。此外，还可以考虑应用美沙拉嗪和奥沙拉嗪，这两种都是比较相似的药物。
糖皮质激素，如强的松和强的松龙是治疗结肠炎急性活动期最有效的药物之一。对于乙状结肠炎，如果出现出血、穿孔、梗阻的患者，应当考虑紧急手术处理。