脚趾甲由于真菌感染引起的趾甲损害称为甲癣，如果趾甲损害表浅或是单纯远端损害，仅仅应用外用药物就可以，例如冰醋酸溶液、碘酊溶液、阿莫洛芬溶液外涂，疗程为3-6个月，直至趾甲变到正常为止。
如果多个趾甲受损，并且发现已经有很多年，需要加用口服抗真菌药物，例如伊曲康唑分散片、盐酸特比萘芬片，疗程也是3-6个月。同时要看病甲的恢复情况，如果病甲没有完全变好，可以适当延长口服药的时间，服药期间要注意监测肝功能。一旦发现转氨酶升高，立即停用口服药物，继续用外用药物治疗，直到病甲光泽、透明为止。