治疗婴儿便秘的方法是有原发病的治原发病，没有原发病的改变膳食的内容，养成排便的习惯，必要时临时用药物治疗，具体如下：
一、人乳喂养的婴儿的饮食矫正，母乳喂养的孩子很少发生便秘。如果发生，除母乳喂养外要加用润肠的辅食，如加糖的菜汁、橘子汁、番茄汁、煮的山楂汁和红枣水，四个月以上可加菜泥和煮熟的水果泥。母乳不足时可加1-2次含8%糖的牛乳，蜂蜜水也有帮助。
二、人工喂养的婴儿的饮食矫正，人工喂养较容易发生便秘，例如合理的加糖及辅食可避免便秘。若发生，可在牛奶内加糖至糖含量8%，并可喂果汁、蕃茄汁、橘子汁、菠萝汁、枣汁以及其他的水果汁，以刺激肠的蠕动。较大的婴儿可加菜泥、菜末、水果、粥等饮食，再大一些可加较粗的谷类食物，如薏米、小米、面片等。
三、要训练排大便的习惯，形成条件反射，小儿经常训练，养成排便习惯，一般三个月以上的婴儿可以开始训练。婴儿在早晨喂奶后，由成人两手把便或坐便盆开始。坐排便的小凳，养成排便的习惯。
四、药物在必要时，如出现排便困难的时候可以选用。要根据情况，根据药物的特性和方法进行有效的选择和使用。