香连胶囊主要由木香和黄连组成，其中黄连是由吴茱萸炮制的，能增强胃肠对水分的重吸收。吴茱萸性温，能制约黄连的寒性特点，木香善行肠胃之气，调畅三焦。香连胶囊具有清热、燥湿、理气的功效，更偏重于理气止泻作用。
木香和黄连都能杀灭痢疾杆菌和肠道上其他的致病菌，在临床上常常被用来治疗肠炎等疾病。腹泻的病人除了服用药物之外，饮食上也要多加注意，急救时可静脉补液，防止脱水。如果是便秘的患者，黄连燥湿的作用会使大便更加干燥，引起便秘的加重，所以便秘患者则禁服本药。