黄皮不仅是一种营养价值很高的水果，还具有很好的药用价值，其中黄皮果根的药用价值比较显著。黄皮果根从中医的角度上来看，它的性味辛、微苦、温；归胃、肝经。
临床认为它具有行气止痛的作用，对于气滞所导致的胃脘疼痛、腹痛，包括疝气疼痛，都具有一定的治疗效果。
此外，气滞血瘀导致的风湿骨痛，外感风邪、寒邪、湿邪所导致的关节疼痛、关节的阻滞不通，甚至关节的肿胀、疼痛，都有一定的缓解作用。
此外，因为它具有一定的温中行气、和胃除胀的效果，所以对女性的少腹胀痛、月经来潮的痛经，有一定的预防效果。