高密度脂蛋白是机体一种保护性的脂蛋白，它有抗动脉粥样硬化的作用。高密度脂蛋白在体内的作用是促进胆固醇的代谢，它可以将周围组织或者动脉粥样硬化血管壁内的胆固醇转移到肝脏，在肝脏代谢为胆汁酸从肠道排出。
所以高密度脂蛋白是一种抗动脉粥样硬化的血脂蛋白，是冠心病的保护因子。高密度脂蛋白偏高对机体是个好事，提示动脉粥样硬化发生的机会减少，罹患心脑血管病的几率减少，高密度脂蛋白一旦下降预示心脑血管疾病的风险加大。
当然动脉粥样硬化和心脑血管病的发生和血脂的多种因素有关，高密度脂蛋白只是其中的一个因素，低密度脂蛋白增高是心脑血管病发生的重要危险因素，也起着重要的作用，高密度脂蛋白偏高对机体是个好事。