维生素D缺乏症的治疗应该根据患者的特征以及病情状况，同时结合维生素D的制剂、剂型，维生素D的检测、季节等因素，综合考虑治疗方案。目前维生素D治疗首选维生素D3作为维生素D制剂，治疗维生素D缺乏症，优先推荐口服补充，然后再考虑胃肠外途径。
推荐治疗方法为固定复核剂量和维持治疗的方法，替代治疗方案包括负荷量的阶段和维持阶段。负荷量阶段为高剂量的维生素D3几周，然后进入到维持阶段。维持阶段可以根据单个患者的需要选择每日补充，或者不频繁的补充。