自然流产的症状主要为停经后出现阴道流血和腹痛，早期流产时妊娠物排出前，胚胎多已死亡，开始时绒毛与蜕膜剥离，血窦开放，出现阴道流血，剥离的胚胎和血液刺激子宫收缩排出胚胎及其他的妊娠物，产生阵发性的下腹痛，胚胎及其附属物完全排除后子宫就收缩好，血窦闭合出血也就停止。
而晚期流产史，胎儿排出前后往往还有生机，其原因多为子宫解剖异常，其临床过程与早产类似，胎儿娩出后胎盘随之娩出，出血不多，也有少数流产前胎儿已经死亡，其原因多为非解剖因素所导致。比如严重的胎儿发育异常、自身免疫性疾病、血栓前状态宫内感染等。所以早期流产的临床过程是先出现阴道流血后出现腹痛，而晚期流产的临床过程是先出现腹痛后出现阴道流血。