雌二醇凝胶主要用于绝经期综合征，比如潮热、出汗、失眠以及急躁等症状，包括自然绝经、手术或药物绝经，还用于治疗各种原因所导致的卵巢功能的失调、雌激素水平的低落。对于雌激素水平下降的妇女，可有预防尿钙丢失、保护骨量、降低骨质疏松的发生和降低骨折率的作用。
雌二醇是育龄妇女卵巢分泌的受体水平活性较高的雌激素，绝经后卵巢功能衰竭，雌二醇的生成几乎就会停止，从而引起血管运动障碍，体温调节不稳定，它的临床表现为潮热、出汗、睡眠障碍、泌尿生殖系统萎缩、骨质疏松等症状。雌二醇吸收入血之后，使血中的雌二醇浓度升高到了卵泡早期的水平，作用于靶器官，从而使以上的症状明显减轻或者消失。雌二醇凝胶的用法是每天早晨或晚间涂半剂量尺于手臂、肩部、头颈部、腹部、大腿部以及脸部，涂后约两分钟就会干，无刺激性，也没有颜色或味道，洗澡之后使用最好。