小孩灌肠可有如下副作用：
1、因孩子的肠壁更薄，肠内黏膜脆弱，给孩子灌肠可损伤肠壁黏膜引发出血或发炎，严重的可造成穿孔。
2、因食品药品监督管理局批准用于灌肠的药物较少，如果给孩子随意改变药物的使用方式可增加药物的过敏几率，容易产生耐药性，也可因局部用药刺激而引发直肠炎，并且灌肠还能改变肠道内正常菌群环境，可引起孩子发生腹泻或便秘。
3、长时间保留大量液体灌肠会使肛门括约肌变松，还可能导致孩子发生水电解质紊乱。