慢性结肠炎指的是溃疡性结肠炎，溃疡性结肠炎是不能根治的，治疗的目的是控制急性发作、黏膜愈合、维持缓解、减少复发，防治并发症。患者在活动期应有充分休息、调节好情绪、避免心理压力过大。急性活动期可给予流质或半流饮食，病情好转后改为富营养、易消化的少渣饮食，调味不宜过于辛辣，注意饮食卫生，避免肠道感染性疾病，不易长期饮酒。按医嘱服药及定期医疗随访，不要擅自停药，反复病情活动者应有终身服药的心理准备。
溃疡性结肠炎按照严重程度分为轻、中、重型，轻型溃疡性结肠炎可以口服5-氨基水杨酸治疗，对于中重度患者用5-氨基水杨酸无法控制病情者，可给予糖皮质激素，糖皮质激素逐渐减停后需要用免疫抑制剂维持治疗。