关于脑炎的分类大体上分成两大类，有菌性脑炎和无菌性脑炎。有菌性脑炎是指细菌性的。细菌性的脑炎有普通细菌的化脓脑膜炎、化脓性脑炎、结核性脑炎，这些都是属于细菌引起的。另外无菌性的分为感染性的和非感染性的。感染性的最常见的是病毒性的脑炎，还有支原体一类的微生物性的脑炎，还有脑囊虫引起的囊虫性的脑炎，炎症性反应。另外还有其他非感染性的脑炎，比方有些叫脑膜癌病或者脑部的癌细胞的脑炎，还有一些就是药物性的非感染性的脑炎，还有变态反应性的、脱髓鞘性的一些脑炎。分类大体上有很多的分类，临床医生有时候都不是按照教科书刻板地进行分类，在临床上都是比较灵活机动的。