可致慢性肝炎或者肝硬化的病毒，在我国主要是乙型病毒性肝炎和丙型病毒性肝炎。上述肝炎若没有给予积极的治疗，很容易导致门静脉高压。此类病毒可以使肝内的纤维束增加，以及肝细胞形成再生的结节。而增生的纤维束及再生的肝细胞结节又会挤压肝小叶内的肝血窦，使其变窄、闭塞，导致门静脉血流受阻，门静脉压力也会随之升高。
此外，由于位于肝小叶间汇管区的肝动脉小分支，和门静脉小分支之间的许多动静脉交通支平时不开放，而在肝血窦受压或阻塞时大量开放，从而使肝动脉的血流直接反输入压力较低的门静脉小分支，使门静脉压力进一步增加，最终形成门静脉高压。而门静脉高压又会导致脾大、脾功能亢进、交通支扩张，以及腹水的形成。