对于小儿坏死性结肠炎，一旦确诊，应当立即给予禁食。轻者需要5-10天，严重的患者需要10-15天，甚至更长的时间。对于腹胀明显的患者，还应当给予胃肠减压。另外，在肛门应用开塞露、一次性灌肠器或者生理盐水进行灌肠，也可以达到较好的缓解腹胀的效果。禁食期间必须给以静脉的补液，维持水电解质以及酸碱的平衡，给予营养的支持。可以考虑给予高糖以及脂肪酸、氨基酸等混合的能量进行补充静脉营养。此外，对于出现坏死性结肠炎的小儿，还应当选用敏感的抗菌药物治疗，坏死性结肠炎主要由革兰氏阴性杆菌造成的，因此多选择第三代头孢菌素，如头孢哌酮舒巴坦、头孢曲松等。如果出现高热，还可以进一步行血培养以及大便培养做药敏试验，选择敏感抗菌药物来进一步进行应用。病情严重的患者，还应当给予及时的对症处理，如需血扩容的患者应当快速的扩容，还可以应用血浆低分子右旋糖酐等。