胃肠道间质瘤化疗效果不是很好，又容易复发，平均寿命大概19个月左右。对于晚期复发转移的间质瘤患者，现在伊马替尼的出现，2002年以后，靶向治疗成为了金标准，效果得到明显的改善，现在平均寿命是59个月，5年左右。软组织肿瘤手术2周就可以达到比较好的状态，可以下地行走，术后1个月可以恢复。但如果涉及到肿瘤比较大、血管置换，术后要吃抗凝药、骨骼重建，要3-6个月，甚至9个月才能长好。另外有些涉及到肠道切除，2个月才能恢复。不同的手术方式患者的恢复是不一样的，大部分的体表中等以下的手术，2个星期左右能够恢复。