鱼肝油主要含有维生素A和维生素D，维生素A又被称为视黄醇，它在体内可以转化为视黄酸。视黄酸是人体生长发育所必需的物质，特别是胎儿、婴幼儿的发育，上皮组织的完整性以及视力等多与视黄醇密切相关。而维生素D经过小肠吸收以后，在肝脏和肾脏进行两次的羟化，变成了骨化三醇。
骨化三醇能够促进小肠上皮细胞合成摄取钙离子和磷的蛋白，从而促进了钙、磷的吸收，能够用来治疗钙缺乏疾病。因此，鱼肝油中所含有的维生素A和维生素D，主要是用来治疗维生素A、D缺乏所导致的各种的疾病。需要注意的是长期服用鱼肝油可能产生慢性中毒，会出现关节的肿痛、皮肤瘙痒、口唇干裂、发热、头痛、呕吐、便秘、恶心等不良反应，还有非常重要的是高钙血症、高磷血症。