植物人是有生理反应的，因为植物人一般是因为大脑、脑干上部的部分大脑功能缺失，以及上行网状激活系统的功能障碍，导致对外界的反应功能丧失。但是在脑干以下的部位，特别是脊髓，一些生理反应是存在的。
脑干以上，对脑干的一些反射也会存在，包括角膜反射、闭眼反射、睁眼闭眼反射，甚至睡眠觉醒的周期，大多是存在的，属于生理反应。还有排便、排尿的反射，中枢都在脊髓，也是存在的，患者会出现自然的排便现象。但患者与正常人的排便是不一样的，刺激后会出现自然排便、排尿，是不受控制的。还有些生理反应，包括性功能的反应，如勃起等反射都会出现，也是正常存在的。