肠系膜上静脉是门静脉的属支，肠系膜上静脉和脾静脉在胰头和胰体交界处的后方汇合而成为肝门静脉。
肝门静脉向右上方，经下腔静脉前方进入肝十二指肠韧带，在肝固有动脉和胆总管的后方上行至肛门，分为两支，分别进入肝左叶和肝右叶，肝门静脉在肝内反复分支，最终注入肝血窦。
肝门静脉的属支包括肠系膜上静脉、脾静脉、肠系膜下静脉、胃左静脉、胃右静脉、胆囊静脉等，多与同名的动脉伴行。
其中脾静脉是起自脾门处，经脾动脉下方和胰后方右行，与肠系膜上静脉汇合成肝门静脉，肠系膜下静脉注入脾静脉或者肠系膜上静脉。