孕激素主要由卵巢的黄体生成，在妊娠期胎盘也能大量分泌孕激素。孕激素的主要作用在子宫内膜，使增生期的子宫内膜转化为分泌期，与雌激素联合发挥作用，使子宫内膜周期性脱落，维持正常的月经周期。
对于怀孕的女性，孕激素有利于受孕、受精卵着床。孕激素可以降低子宫平滑肌的兴奋性，抑制宫缩，有利于胚胎和胎儿在子宫内的发育、还可以促进乳腺腺泡的发育，有轻微的致热作用，可以作用在中枢神经系统，使体温略升高，使体温在月经周期呈现双向变化。孕激素对保持女性正常的月经周期和怀孕至关重要，如果孕激素水平低下会导致女性月经周期紊乱、不孕、流产等。