疱疹性咽峡炎与手足口病是不同的，它们共同点都是病毒感染，疱疹性咽峡炎的症状主要是发烧、咽部疼痛，检查时在咽喉部可以看到有疱疹，抗病毒治疗是有效的。手足口病主要是发烧、皮疹，皮疹的部位除了咽喉部的疱疹以外，有手心、脚心的疱疹，还有肛门周围的疱疹，皮疹部位是多个，还伴随有发烧的症状，在咽喉部的症状可能和疱疹性咽峡炎有相似，这就是它们的区别。