直肠是最容易得病的器官，常见的疾病有痔疮、直肠炎、直肠息肉和直肠肿瘤。由于直肠是消化道的最末端，所以症状也比较特殊，最常见的症状就是直肠刺激症状，表现为便意频繁、排便不尽感、里急后重、大便疼痛、分泌物增多、会阴部坠胀感等等。
根据疾病的不同，还可以出现便血、大便变细、排便困难、便秘、腹泻，也会出现排便习惯的改变，就是腹泻与便秘交替的现象。有时会有小腹部的疼痛不适、腹胀等，还可以出现黏液脓血便，严重时可以出现肠梗阻、肠穿孔等。