卡氏肺孢子菌肺炎是比较特殊的病原体感染以后所出现的肺炎，病原体叫卡氏肺孢子菌，现在的叫耶氏肺孢子菌，是属于真菌的病原微生物，以前认为是一种原虫，但是后来随着对病原微生物基因组学的研究发现，跟真菌有很多类似的地方，所以又把叫做一种真菌。
细菌或者真菌感染起来是机会性的感染，一般只见于免疫低下或者是长期服用激素的患者，一般正常人是很少感染的。一旦感染这个菌，病情会很凶猛，而且进展会非常地快，很多患者都会很快就进入到呼吸衰竭阶段。一般可以给予患者抗真菌的治疗，比方像卡泊芬净，再加上磺胺治疗，一般治愈率在80%以上，但是需要及时早期发现才能治愈比较好。