双侧附睾炎的辨别要通过病史、查体、化验和影像学的检查来完成。
病史：患者有双侧阴囊疼痛不适的病史，有时患者伴有寒战、发热；查体：双侧附睾增大并有压痛；化验可以通过血常规白细胞明显升高，中性粒细胞所占比例升高，尿常规有时可见红、白细胞。
影像学检查多是通过彩超，彩超可见双侧附睾增大，内并见血流信号明显增多，此时首先考虑双侧附睾炎，并给予抗炎治疗，治疗后双侧睾丸疼痛及压痛的症状明显好转。
此时可以同时除外了附睾结核的可能，因为附睾结核普通的抗生素治疗是无效的。