母婴传播是新生儿HIV感染的主要途径，通过产前、产时和产后三种方式感染，分别是：
一、产前感染，一般认为母亲病毒载量越高和免疫水平越低，新生儿发生HIV感染的危险性就越大。母血中的HIV可直接感染绒毛膜细胞和经胎膜破损缺口进入胎儿循环，这种形式的感染占母婴传播的25%左右。
二、产时感染，分娩时期过程的感染，胎儿可通过接触含有HIV母血及宫内阴茎、阴道分泌物而被感染，其感染HIV几率与分娩时期的长短，分娩的方式和阴道分娩有无胎膜早破和侵袭性操作有关，具体的途径包括：1、宫缩时因胎头直接接触母体子宫和阴道分泌物而感染。2、会阴切开术，应用胎儿头皮电极和阴道助产时，致胎儿皮肤和黏膜破损，则伤口直接被母血的和产道的分泌物污染。3、若分娩时存在窒息，可使新生儿吞入污染的羊水。4、母体存在细菌性感染时，母体被HIV感染的T细胞进入羊水中，并通过胎儿的皮肤、黏膜、肠道和肺进入胎儿体内，产时新生儿感染，HIV的风险率最大，占母婴传播的65%。
三、产后感染就是哺乳感染，主要通过母乳或混合喂养而感染，乳汁内的HIV可以通过新生儿的口腔和胃肠道感染的新生儿，通过母乳喂养而感染的HIV的新生儿占12%。