甲型和乙型流感病毒抗原检测，如果都是阴性的情况下，只能提示可能没有感染甲型或者是乙型流感病毒，但是却不是绝对的。
因为目前无论是采用胶体金的方法，还是采用PCR的方法来检测甲型或者乙型流感病毒，都有一定的假阴性结果。所以是否诊断流感，一定要结合病人实际的情况全面评估病情，比如有没有跟流感病人有密切接触过，有没有流感样的症状，也就是有没有高烧，同时伴有乏力、全身不适，甚至有的人可能还有胃肠道反应等等。再根据血常规化验白细胞总数正常或偏低，同时结合甲型乙型流感病毒检测来确定。
如果临床上高度可疑流感病毒感染，即便是查出来甲型或者是乙型流感病毒抗原检测阴性，仍然可以采用治疗流感的奥司他韦来进行诊断性治疗。