早期的小肠间质瘤还属于良性肿瘤，一般通过积极治疗，大部分病人可以彻底治愈，一般不会影响到寿命，中期的小肠间质瘤的病人，5年生存率70%左右。
早期的小肠间质瘤，肿瘤的体积<2cm，还属于良性肿瘤，一般通过积极治疗，大部分病人都是可以彻底治愈，一般不会影响到寿命。中期的小肠间质瘤的病人，5年生存率70%左右。如果不积极治疗，随着肿瘤体积的增大和时间的延长，就会出现不同程度的恶变，对于中晚期的间质瘤病人，积极的手术治疗后需要配合化疗、放疗、靶向药物治疗等等，控制病情防止复发，早发现、早诊断、早治疗是治愈癌症和延长生命的关键。
小肠间质瘤术后要注意饮食调养应以温、软、淡、素、鲜为宜，做到定时定量、少食多餐。保持精神愉快和情绪稳定，同时注意劳逸结合，保暖护养，适时增添衣服，睡觉盖好被褥，避免着凉。