耳后神经痛原因很多，首先要关注耳部疾病，如外耳道炎、中耳炎、耳部肿瘤等，需要耳鼻喉科会诊，颅底核磁共振检查，排除耳部器质性病变导致的症状。其次，颅内占位性病变也可以导致，需要行头颅核磁共振检查来明确病因。同时耳部带状疱疹、神经痛也可以产生症状，需要耳鼻喉科明确耳道内带状疱疹的发生，之后到疼痛科进行规范化的治疗。临床肿瘤转移也可以产生症状，所以要关注肿瘤病人是否发生骨转移或是颅内转移。
排除上述情况以后，临床颈椎病、颈肩部软组织损坏、颈椎小关节病变，都会刺激颈部神经、耳后神经而产生症状，需要行颈椎核磁共振检查后，进行相应的疼痛科微创介入治疗来缓解这种症状。同时对于急性疼痛患者，在明确病因之前可以口服加巴喷丁来缓解疼痛。