小儿甲状腺功能减退的症状，一般在新生儿期表现不明显。如果追问病史，可以发现孩子在新生儿期，可以出现生理性黄疸延长。另外，孩子会出现嗜睡、哭声少、哭声低下、吸引力差、体温低、便秘、前囟较大、后囟未闭，可以出现心率减慢、心音低钝的情况。
如果在幼儿出现甲状腺功能减低，或者儿童期可以表现为生后数月或1年以后，出现甲状腺严重缺乏，可以出现特殊的面容，如面部臃肿、表情比较淡漠、反应迟钝、毛发稀疏、厚舌、舌大，然后舌外伸、眼、脸水肿。神经功能表现为智力低下、记忆力注意力比较降低、运动发育迟缓、行走延迟，并且伴有听力的减退、感觉迟钝、嗜睡，严重的可以出现全身黏液性水肿。
另外，孩子生长发育迟滞、身材比较矮小、躯体长四肢短；心血功能低下、脉搏比较细弱、心音低钝、心脏扩大，可以出现心包积液，心电图呈现低电压、PR间期延长、传导阻滞；还可以出现消化系统功能的紊乱、纳差、腹胀、便秘、大便干燥。