强直性脊柱炎的病因目前不明确，就是没有确切的病因，但是研究发现它和很多因素相关，比如遗传、环境因素、感染、免疫等等，但是没有哪一个是它的确切病因，比如遗传，研究发现强力性脊柱炎有一个基因就是hla-b27，这个基因的阳性率非常高，所以经常在临床当中为了去诊断强直性脊柱炎也经常会查hla-b27，但是不是说这个指标阳性就一定是强直性脊柱炎，它有一定的假阳性。
另外，有些人认为跟泌尿生殖道的衣原体感染有关系，还有环境，比如长期在潮湿的环境下，就是以前老百姓说的风湿，潮湿的环境有可能跟强直性脊柱炎的发病相关，但是目前来讲，还没有研究说明某一个病因就是它确切的病因，只是跟这些因素相关。