甲状腺功能减退症对妊娠的影响，是通过改变下丘脑-垂体-甲状腺轴和下丘脑-垂体-卵巢轴而实现的。
这样就导致了患者在性发育、月经周期、排卵、胎盘植入以及流产等多个环节影响生殖功能，甲状腺功能减退症对胚胎的影响有：
第一、导致胚胎发育停止；
第二、流产；
第三、不孕症。对于不良孕产史的妇女，例如胚胎发育停止、习惯性流产以及不孕症等表现的妇女，常规检查甲状腺功能就显得尤为重要。原发性甲状腺功能减退症应用左甲状腺素片治疗，妊娠期间甲状腺功能减退症可以将流产率显著降低。
总之，一旦确诊妊娠期间出现了甲状腺功能减退症，就需要立即补充甲状腺激素，以提高妊娠质量，从而减少妊娠期间并发症的发生和发展。