肝脓肿是指细菌真菌以及阿米巴原虫等多种微生物引起的肝脏化脓性的病变，其中细菌性肝脓肿最为多见。常为多种细菌感染所导致的混合性病变约为80%，而阿米巴脓肿约为10%，一般多见于草原的牧区，其中真菌性的肝脓肿总是最低的，不到10%。阿米巴肝脓肿发病和阿米巴结肠炎有着密切的关系，脓肿大多为单发。细菌性的肝脓肿，细菌入侵的途径除了败血症以外，还可以有腹腔内的感染直接蔓延所导致，如急性的阑尾炎，也可以由脐部感染，经脐血管门静脉进入肝脏。胆道蛔虫也是细菌性肝脓肿常见的诱因，常见的细菌有金黄色葡萄球菌以及链球菌。在开放性的肝损伤时，也可以直接导致肝脓肿的形成。另外，急性胆管炎发作也可以导致肝脓肿的发生，还有原因不明的肝脓肿成为隐源性肝脓肿可能和肝脏已经存在的疾病有关，长期存在的糖尿病也可以造成肝脓肿的形成。