通常来讲，甲亢没有控制的患者不建议怀孕，因为抗甲状腺药物可能会导致胎儿的畸形，抑制胎儿的甲状腺功能。如果可能，在怀孕期间，特别是妊娠前12周，尽量不要服用抗甲状腺药物。如果确实需要服用抗甲状腺药物，在妊娠前12周优先选择丙硫氧嘧啶片进行治疗。在妊娠的中晚期，可以换用甲巯咪唑片进行治疗。
对于正在接受抗甲状腺药物治疗的患者，甲状腺功能恢复正常以后，应该向医生咨询是否可以怀孕。在怀孕期间，如果服用抗甲状腺药物进行治疗，应该根据母亲血液中甲状腺的功能，调整药物的剂量。