动脉血栓往往根据其发生的部位以及产生的原因采用不同的治疗方法，如果是颅内的动脉血栓，在急性期六小时以内可以采用介入下进行吸栓的方法或者是取栓的方法，以此来开通颅内动脉，可以很好地改善偏瘫和失语的症状。
如果是脏器的动脉血栓，对急性期内，临床上往往采用介入下导管溶栓的方法，溶栓6-12小时可以将大部分血栓溶掉，恢复脏器的供血。
如果同时存在着狭窄，可以在介入下进行球囊扩张和支架植入术。
如果是肢体的动脉血栓，急性期内可以采用开刀的方法进行Fogarty球囊导管取栓术，也可以采用介入下进行吸栓的方法，也可以采用动脉下介入置管溶栓的方法来进行溶栓。