急性上呼吸道感染主要是由于机体的免疫力下降，受到病毒、细菌等病原体的感染，引起上呼吸道黏膜的炎症反应。但是随着炎症的加重，患者本身抵抗力比较差的情况下会有并发症，并发症可出现急性鼻窦炎、急性中耳炎以及咽喉壁有脓肿，还可能会出现颈部的淋巴结发炎，引起肿痛。还可能会引起炎症向下呼吸道进一步发展而蔓延，导致下呼吸道感染，比如气管炎、支气管炎、肺炎。少数患者由于感染了特殊的病原体，比如溶血性链球菌，可能会并发风湿热、肾小球肾炎以及病毒性心肌炎等。