运动神经的损伤治疗，先要根据引起损伤的病因进行治疗，如果是外伤性，可以通过手术修复，再给予营养神经的药物进行治疗。如果是中毒性、代谢性，要纠正代谢因素和中毒的因素，来进行高压氧的治疗。
另外，可以给予脑蛋白水解物、神经节苷脂、鼠神经生长因子、甲钴胺、维生素B1、维生素B6等，促进神经的修复，然后再通过康复的训练来促进神经功能的恢复。通过病因的治疗、营养神经药物的治疗，还有康复的训练，可以让运动神经损伤造成的功能障碍恢复最佳，通过3-6个月时间的治疗，可以恢复80%-90%的运动神经功能。