灰指甲又称甲癣，是真菌感染性疾病中比较顽固、难治的一种。要想清除灰指甲，需要口服抗真菌药物治疗，常用口服抗真菌药物有特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑，每种药物用法、用量及疗程均有不同，并且抗真菌药物对肝脏也有一定影响。所以口服抗真菌药物治疗灰指甲，需要由临床医生给予指导下才能选择应用。
此外，也可以选择局部外用药物治疗，比如可用30%的冰醋酸外涂，或者使用10%的冰醋酸泡病甲。涂药前要先将病甲刮薄，疗效才能好一些，同时也要注意保护好甲周围正常皮肤。还有一些其他外用方法，如水杨酸、乳酸或酒精溶液，以及10%的碘酊、40%尿素软膏，上述外用药物包敷病甲后，再移除病甲也可以起到治疗作用。但灰指甲治疗相对比较顽固，治疗周期也相对比较长，而且涉及用药对肝脏也有影响。要想口服抗真菌药物治疗，必须由临床医生给予指导，相应外用药物治疗方式也有所不同，都需要听从医生医嘱。