阻断药对肾脏不会有任何后遗症，对肝脏的后遗症主要是可能会导致肝细胞变性坏死、肝硬化。阻断药是指患者与艾滋病患者同房或接触艾滋病血清后，72小时内通过药物避免艾滋病感染。
在阻断药的使用过程中，因药物本身或及其代谢产物或由于特殊体质对药物的超敏性和耐受性低，可以导致肝损伤。服用阻断药出现肝损伤，立即停用有关可疑药物，促进体内药物清除和应用解毒剂，应用肝细胞保护剂治疗肝功能损害。注意休息，补充足量的热量、蛋白质、维生素，促肝细胞修复和再生。目前常用的阻断药有齐多夫定、拉米夫定、克力芝，主要不良反应是胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹泻等，头痛、失眠，还有骨髓抑制，对肝肾损害较轻。停药后这些不良反应可以消失，极少留下后遗症。