扁平疣发黑不是癌变，扁平疣发黑最主要的原因是扁平疣时间长了，外面的皮层出现了一定氧化，还有可能引起周边皮肤黑色素的沉着，引起了相应黑斑，因为扁平疣本身以皮色或者比较深的褐色、接近于黑色散在或群集的扁平角化性丘疹为基础特征，主要由于乳头状瘤病毒引起，这种乳头状瘤病毒一般不会癌变，不属于高危型。
扁平疣治疗上主要用一些比如光动力疗法，或者抗病毒的药物、免疫调节剂、激光，还有冷冻这样的外治方法，来消除掉。总之扁平疣发黑不属于癌变，不用过分担心。