子宫内膜异位症在临床上，有一些部位的异位症病灶通过B超能检查出来，有一些通过B超很难检查出来。
如果是由于剖宫产术后腹壁伤口的子宫内膜异位症，除了结合临床病史，在月经期的时候，腹部的伤口局部会出现疼痛并且有结节，通过B超是可以检查出来的。另外，如果是子宫内膜异位症的病灶在卵巢，形成了卵巢巧克力囊肿，通过B超也可以检查出来。
如果是子宫内膜异位症病灶在阴道，通过B超检查往往检查不出来，这种异位症的病灶非常小，只有在妇科检查时可以摸到异位症的病灶，有明显的触痛，且在临床上结合病史，在来月经的时候这种疼痛往往会加重。