大部分继发性肺结核能够治愈，只有少部分继发性肺结核成为耐药结核，治疗时间会延长，继发性肺结核与原发性肺结核有明显差异，继发性肺结核有明显的临床症状，容易出现空洞和排菌，具有传染性。
继发性肺结核分两种类型：一种类型是发病慢，临床症状少而轻，多发生在肺尖或者锁骨下，痰涂片可能呈阴性，一般预后良好；另一种继发性肺结核，进展速度快，几周之前肺部CT正常，发现时已经出现广泛病变，如空洞、播散，痰菌涂片呈阳性，这类病人多发生在营养不良或抵抗力低的群体，还有免疫功能受损的患者，继发性肺结核经过积极的抗结核治疗，绝大部分患者能很好的吸收，少部分患者呈耐药性肺结核，迁延不愈。继发性肺结核抗结核治疗原则是早期、全程、足量、联合、规律用药，整个治疗方案分强化期和巩固期两个阶段。